Viser opslag med etiketten x-faktor. Vis alle opslag
Viser opslag med etiketten x-faktor. Vis alle opslag

22. maj 2014

Pedigree Matching er blevet til PM Online

PM står for Pedigree Matching, og PM Online betyder, at det er en internetudgave af Norman Halls Pedigree Matching database med faciliteter, der gør det muligt at se stamtavler og diverse avancerede rapporter for heste fra hele verden. Det er verdens største internationale database over travheste og pacere (Standardbred), og databasen rummer også en afdeling for fuldblodsheste og Quarter horses. I alt er der 3,7 millioner heste i databasen, og der kommer flere til hver eneste dag.

PM Online er en betalingsside, og abonnement på basisversionen koster 50 CAD svarende til 250 kroner om året. Norman Hall har imidlertid tilbudt DTC, at alle registrerede travhesteejere, opdrættere, trænere, jockeys og amatører i Danmark kan få fri adgang til basisversionen, hvis PM Online får lov til at bruge data fra DTC’s database. DTC undersøger i øjeblikket, om de vil give en sådan tilladelse.

PM Online har – selv uden DTC’s medvirken – langt flere ældre danske heste i databasen end DTC’s Sportsinfo. Til illustration af dette kan man f.eks. sammenligne stamtavlen for den gamle derbyvinder Onward Eagle, som den ser ud på DTC’s Sportsinfo og på PM Online.

Stamtavlerne for danske heste er således mere komplette på PM Online end på DTC’s Sportsinfo.

En anden fordel ved PM Online i forhold til de nationale databaser er, at PM Online viser heste fra alle lande. Ønsker man f.eks. en afkomsliste for en avlshingst med afkom i flere lande, så viser PM Online alle afkom, hvor de nationale databaser kun viser afkom i det pågældende land.

Den udvidede version af PM Online – Guru niveauet – giver adgang til mere avancerede søgninger samt mulighed for at tilføje og redigere heste i databasen. Abonnement på Guru versionen koster 200 CAD svarende til 1.000 kroner om året.

Link til PM Online, hvor man kan åbne en konto og få et gratis 2-dages prøveabonnement: Klik her

28. december 2012

Hvorfor fik Miss Russell så stor betydning for avlen?

Min artikel fra 2004 "Miss Russell - dronning blandt dronninger" forsøgte at besvare spørgsmålet: Hvorfor fik Miss Russell og de andre nøglehopper så stor betydning for avlen?

Miss Russell (1865-1898)

Der blev angivet to forskellige svar. Det første svar var fra Marianna Haun, der i 1997 i sin bog  “The X-Factor, What is it & how to find it" lancerede X-faktor teorien, hvor hun antager, at fuldblodshoppen Pocahontas (1837) er kilden til fænomenet “store hjerter”, der beskrives som årsag til særlig gode resultater for væddeløbsheste.

Det andet svar kom fra Norman Hall, der i sin bog “QUEEN AMONG QUEENS, The Power Behind The Throne” skriver, at kilden til X-faktor genet skal findes helt tilbage i fuldblodsavlens oprindelse, og at sporet fører til helbrødrene Flying Childers (1715) og Bartlets Childers(1716), sønner af Darley Arabian (ca. 1680-1720) eller faktisk helt tilbage til deres mormor, Spanker Mare (ca.1690).

Flying Childers er stamfaderen til den amerikanske traverrace via Messenger (1780-1808) og Hambletonian 10 (1849-1876). Bartlets Childers har dannet en linie, som via Eclipse (1764) er blevet den dominerende hingstelinie i fuldblodsavlen.

Der er imidlertid ikke videnskabelig dokumentation for nogen af disse forklaringer. Jeg tror dog, at nogle egenskaber er knyttet til X-kromosomet, men tvivler på teorien om det store hjerte. Årsagen er, at jeg af Rikke Buhl fik lov til at gennemgå materialet fra undersøgelserne i forbindelse med hendes Ph.D. afhandling, ”Development of cardiac dimensions assessed by echocardiography in young standardbred trotters”, som hun forsvarede på KVL den 8. oktober 2004. Meningen var, at jeg skulle prøve at finde en sammenhæng mellem måleresultater, væddeløbskarrierer og X-faktor afstamning. Jeg måtte imidlertid konkludere, at der ikke kunne konstateres nogen signifikant sammenhæng.

Som sagt vil jeg ikke afskrive X-kromosomets betydning som bærer af bestemte egenskaber, men der mangler stadig viden om, hvilke egenskaber det er. Hvis man definerer X-faktor teorien som nedarvning af egenskaber knyttet til X-kromosomet, så tror jeg stadig på X-faktor teorien. Det kan meget vel være en effekt på det cardiovaskulære system, hvis det ikke er selve hjertets størrelse, der bestemmes af X-kromosomet.

Også mtDNA må have stor betydning. Ellers er det vanskeligt at forklare, hvorfor enkelte hoppelinier har produceret så mange af verdens bedste væddeløbere. Jeg kan altså ikke udpege én teori som den vigtigste. Genetik er et kompliceret samspil af mange faktorer.

For at vende tilbage til det oprindelige spørgsmål, om hvorfor Miss Russell og de andre nøglehopper fik så stor betydning for avlen, så mener jeg, at den nyeste forskning  har hjulpet os på vej til et svar, idet en forskergruppe  på Universitetet i Uppsala har opdaget et enkelt genpar (DMRT3), der bestemmer om en hest er født med at kunne bevæge sig hurtigt i trav eller pasgang uden at slå over i galop. Opdagelsen er beskrevet i artiklen "Franske avlshingste bør testes for nyopdaget gen".

Forskergruppen har også konstateret, at alle amerikanske travere og pacere har dette specielle genpar, altså at begge gener på dette locus er af den specielle muterede type, DMRT3. Da genet er recessivt, er dette nødvendigt for at egenskaben slår igennem. DMRT3 genotypen for amerikanske travere og pacere angives som aa, idet recessive gener skrives med små bogstaver.

Alle fuldblodsheste  og koldblodsheste har DMRT3 genotypen CC, hvorimod 67% af islændere med fire gangarter har DMRT3 genotypen Ca og 31% har genotypen aa. Af islændere med fem gangarter har 98% genotypen aa.

Hvorfor fik Miss Russell så stor betydning i avlen? Mit svar er, at det skyldes hendes farfar, Canadian Pilot, der var pacer. Han har altså haft muterede DMRT3 gener og dermed DMRT3 genotypen aa.

Den almindelige opfattelse dengang var, at man bedst producerede en god traver ved at krydse de hopper, der viste de bedste evner for trav, med fuldblodshingste. Derved håbede man at forbedre både hurtighed og udholdenhed. De fleste hopper har sandsynligvis været af DMRT3 genotype CC, enkelte hopper kan have været Ca på grund af pacerafstamning, og alle fuldblodshingste var CC.

Robert Alexander på Woodburn Farm, Kentucky, foretog derimod den genistreg, at han i 1858 købte Pilot Jr. for at gennemføre et systematisk og omhyggeligt planlagt eksperiment med henblik på at producere avlshopper ved at anvende ham til en række (indavlede) fuldblodshopper. Det var så meningen, at de hoppeføl, der kom ud af forbindelsen, skulle anvendes som avlshopper og føres til travhingste. Da Canadian Pilot som pacer må have haft DMRT3 genotypen aa, har sønnen Pilot jr. haft genotypen aa eller Ca. Afkom efter Pilot jr. har dermed haft en god chance for at blive genotype Ca, og som følge deraf har Pilot jr. kunnet udbrede det muterede DMRT3 a-gen til en stor del af populationen efter ham. 

Et af de hoppeføl, der kom ud af Robert Alexanders eksperiment var Miss Russell, og hun blev bl.a. mor til verdensrekordhoppen Maud S (2:08 3/4 i 1879). I alt producerede hun 17 føl, hvoraf flere har haft stor indflydelse på travavlen i mange lande. Et andet hoppeføl efter Pilot jr. var Tackey, mor til Pilot Medium, som blev far til Peter the Great.





27. december 2012

Miss Russell - dronning blandt dronninger

 
Diomed (1777-1808)
Diomed (1777-1808)
Historien om Miss Russell begynder i virkeligheden i 1799 - året hvor fuldblodshingsten Diomed ankom til Amerika. Hans historie er eventyrlig. Han var vinder af det første Epsom Derby, der blev afholdt i 1780. I avlen hjemme i England blev han imidlertid en fiasko, og derfor blev han i en alder af 22 år eksporteret til Amerika. Her virkede han i avlen i 8 år til sin død i 1808, og havde fantastisk succes, idet han blev en af grundlæggerne af den amerikanske fuldblodsavl.

Sir Archy (1804-1833)
Sir Archy (1805-1833)

Diomeds bedste søn var Sir Archy, der betragtes som den første store fuldblodshingst opdrættet i Amerika. Som 4-åring vandt han 4 ud af 5 løb over distancen 4 miles - et af dem i rekordtiden 7’53”. Som hingst opnåede Sir Archy hæderstitlen “The Godolphin of America” fordi hans indflydelse som far og bedstefar var lige så stor i Amerika som Godolphin Arabians havde været i England i midten af 1700-tallet. I de næste generationer fik han endnu større betydning, da indavl på Sir Archy og på hans far, Diomed, blev meget udbredt. Hoppen Bonnets O’Blue er et godt eksempel som datter af Sir Archy’s søn, Sir Charles, og Sir Archy’s datter, Reality. Bonnets O’Blue blev mor til fantomhoppen, Fashion.

Miss Russell (1865-1898)
Miss Russell (1865-1898)

Miss Russell blev opdrættet af R.A. Alexander på Woodburn Farm, Kentucky. Hun blev født i 1865 som datter af Pilot Jr. og Sally Russell.

Far til Pilot Jr. var den canadiske pacer Canadian Pilot (1823), en lille (143 cm), kraftig og udholdende, sort hest, og mor til Pilot Jr. var Nancy Pope ved Funk’s Havoc, en søn af fuldblodshesten Sir Charles ved Sir Archy (søn af Diomed). Mormor til Pilot Jr. var Nancy Taylor ved Craig’s Alfred, en søn af den importerede fuldblodshingst Medley. Pilot Jr. var en skimlet traver, og i modsætning til sin far var han relativt stor (163 cm). Pilot Jr. (1844) var kongen blandt Kentuckys avlshingste i en årrække, og en af hans døtre, Tackey, producerede Pilot Medium, far til Peter the Great.

 
Miss Russells mor, Sally Russell, var som det ses af stamtavlen ekstremt meget indavlet på de ovenfor omtalte fuldblodshingste, Sir Archy og Diomed.

Pilot Jr. blev købt af Robert Alexander i 1858 for at gennemføre et systematisk og omhyggeligt planlagt eksperiment med henblik på at producere avlshopper ved at anvende ham til en række (indavlede) fuldblodshopper. Det var så meningen, at de hoppeføl, der kom ud af forbindelsen, skulle anvendes som avlshopper og føres til travhingste. En af dem var Miss Russell, og hun blev bl.a. mor til verdensrekordhoppen Maud S (2:08 3/4 i 1879). I alt producerede hun 17 føl, hvoraf flere har haft stor indflydelse på travavlen i mange lande. Det er især gennem Nutwood, hendes første søn, at Miss Russells arv føres videre.

De nedenstående stamtavler for Oniska, Adioo, Manette og Margaret Parrish er eksempler på dette. Alle 4 hopper samt Miss Russell selv er nøglehopper i henhold til Norman Halls teorier. (Tryk på billederne for at forstørre dem).

San Francisco f.1903 v/Zombro (McKinney) af Oniska (Nutwood Wilkes)
 
Oniska (1898) er mor til San Francisco, som var avlshingst på Walnut Hall Farm, Kentucky, og det er gennem hans døtre, at det indavlede Miss Russell blod i Oniska er ført videre. En af hans døtre var Cita Frisco, mor til Volomite, en legende, som har haft enorm betydning for travavlen. Volomite’s døtre nedarver således Miss Russell blodet. Det samme gør Star’s Pride’s døtre, idet Dillcisco, Star’s Pride’s mormor, får blodet både fra sin far, San Francisco, og fra sin mormor, der var ved Baron Dillon, endnu en hingst efter en datter af Nutwood. Lida W er mor til både Nutwood Wilkes (far til Oniska) og Direct Line (morfar til Oniska). Oniska er således indavlet 2x3 på Lida W, og Miss Russell blodet er dermed doblet op i Oniska.
 

Adioo (1895) er datter af By By (som igen er datter af Nutwood). Paceren Adios har Adioo som morfars mor, og Dillon Axworthy har Adioo som mormor (Hans mor, Adioo Dillon, er pacer). Helen Hanover, der er involveret i mange moderne pacer-stamtavler, er indavlet 3x2 på Dillon Axworthy.


Manette (1878) er datter af Nutwood, og derfra nedarver hun Miss Russell blodet. Hendes morfar, Tattler, er efter Pilot Jr. ligesom Miss Russell, og hun er således linieavlet 3x3 på Pilot Jr. Manette er mor til verdensrekordhingsten Arion (1889).

Margaret Parrish (1908), som findes i et overvældende stort antal af stamtavlerne for de bedste væddeløbere i dag, er indavlet 3x2 på Arion. Robert Alexanders eksperiment blev en stor succes, og Pilot Jr. hoppernes efterkommere har produceret mere end 350 avlshingste, herunder avlsmatadorer som Diamond Way, Coktail Jet, Ayres, Noble Victory, Florida Pro, General November og Pine Chip. Varenne er også et eksempel.
Blandt Pilot Jr. hopperne kan fremhæves Kathleen (nøglehoppe), Miss Russell (nøglehoppe), Midnight, Lady Hurd, Molly Trussell, Waterwitch, Dahlia, Juliet, Kate, Croquette, Flora, Lady Curry, Minerva, Pilot Jr. Mare, Crop, Kate Anderson, Lady Pilot, Pilot Anna, Santa Maria og Tackey.

Hvorfor fik Miss Russell og de andre nøglehopper så stor betydning for avlen?
Det er let at konstatere disse hoppers indflydelse på avlen, men det er svært at svare på, hvorfor de fik denne indflydelse. En mulig forklaring kan måske findes i X-faktor teorien, som Marianna Haun lancerede i 1997 med sin bog “The X-Factor, What is it & how to find it”. Marianna Haun antager, at fuldblodshoppen Pocahontas (1837) er kilden til fænomenet “store hjerter”.

Norman Hall mener, at kilden til X-faktor genet skal findes helt tilbage i fuldblodsavlens oprindelse, og at sporet fører til helbrødrene Flying Childers (1715) og Bartlets Childers (1716), sønner af Darley Arabian (ca. 1680-1720) eller faktisk helt tilbage til deres mormor, Spanker Mare (ca.1690). Flying Childers er stamfaderen til den amerikanske traverrace via Messenger (1780-1808) og Hambletonian 10 (1849-1876). Bartlets Childers har dannet en linie, som via Eclipse (1764) er blevet den dominerende hingstelinie i fuldblodsavlen.
Spanker Mare (1690)
I bogen “Inbreeding to Superior Females” udgivet i 1999 af Leon Rasmussen & Rommy Faversham beskrives Spanker Mare som det individ, der har haft størst betydning for fuldblodsavlen nogensinde. Alligevel er hun næsten blevet glemt i historieskrivningen i flere hundrede år. Hun blev opdrættet af Lord James D’Arcy, stutterimester for Kong Charles II af England.
Det mest bemærkelsesværdige ved hende er imidlertid ikke den royale oprindelse, men hendes stamtavle, som findes i Englands første stambog. Hun var et produkt af en hingst, der blev ført til sin egen mor. Old Morocco Mare er mor til både Spanker og Spanker Mare ved hendes søn Spanker. Det er indavl så nær, som det kan lade sig gøre. Som om det ikke var nok, fortsatte man med at anvende en søn af Spanker ved navn Old Careless til en datter af Spanker Mare ved navn Cream Cheeks. Resultatet blev Betty Leedes, som er mor til Flying Childers og Bartlets Childers.

Artiklen begyndte med omtale af Diomed (1777-1808), og nu kan ringen sluttes, idet han kan være nøglen til forklaringen på Miss Russells betydning. Hvis Spanker Mare havde den værdifulde genetiske X-faktor, så kan Diomeds kraftige tilstedeværelse i Miss Russells stamtavle være årsagen til hendes succes. Diomed har nemlig ni forbindelser til Spanker Mare i sin stamtavle, og tre af dem er i såkaldte X-faktor positioner i hans mors stamtavle. To af forbindelserne på modersiden er hopper ved Flying Childers og Bartlets Childers. Pocahontas, som Marianna Haun antager er kilden til X-faktor genet, er sandsynligvis blot et led i kæden af X-faktor heste, idet hun har Diomed-døtrene Giantess og Young Noisette på modersiden i stamtavlen.

Denne artikel er baseret på Norman Halls bog “QUEEN AMONG QUEENS, The Power Behind The Throne”. Artiklen blev trykt i Væddeløbsbladet juli 2004.

20. december 2012

Slægtskabsgrad er vigtigere end hingstelinie

Avlshingste bliver traditionelt inddelt efter hingstelinier. I hver generation er der enkelte hingste, der dominerer avlen og som giver arven videre til en eller flere sønner, der igen er så dominerende, at de kan fortsætte den direkte hingstelinie. Hingstens totale genetiske arv, genotypen, afhænger dog ikke kun af hingstelinien men af hele hingstens stamtavle. Det er formentlig af praktiske grunde, at man har begrænset sig til at fokusere på hingstelinierne, da det er meget kompliceret at tage hensyn til det samlede slægtsskab.

I det følgende er der opstillet en beregning af slægtskabsgraden for de mest betydende avlshingste i forhold til de liniedannende hingste. Slægtskabsgraden er defineret som andelen af identiske gener (%).

Andel af potentielt identiske gener (%) for amerikanske hingste født 1895-1975 og liniedannende hingste født 1880-1940:
Klik på billedet for at forstørre det

Andel af potentielt identiske gener (%) for amerikanske hingste født 1976-1994 og liniedannende hingste født 1880-1980:
Klik på billedet for at forstørre det

Andel af potentielt identiske gener (%) for amerikanske hingste født 1995-2005 og liniedannende hingste født 1880-1980:
Klik på billedet for at forstørre det

Andel af potentielt identiske gener (%) for amerikanske hingste født 1995-2005 og liniedannende hingste født 1980-2000:
Klik på billedet for at forstørre det
Når der over tabellerne står, at det er amerikanske heste, er det ikke helt rigtigt, idet der er medtaget enkelte svenske, italienske og tyske heste af amerikansk afstamning.

De klassiske amerikanske hingstelinier er:
  • McKinney f.1887
  • Bingen f.1893
  • Axworthy f.1892
  • Peter the Great f.1895
Af disse er det faktisk kun Peter the Greats hingstelinie, der er levende. De andre hingste findes dog stadig i betydeligt omfang i stamtavlen for vore dages travheste. Axworthy-blodet udgør f.eks. 14-15% i stort set alle amerikanske travere, uanset hvilken hingstelinie de tilhører. De tilsvarende tal for McKinney, Bingen og Peter the Great er henholdsvis 9-10%, 7-8% og 19-20%.

Hingstelinierne kan være misvisende. Det paradoksale er nemlig, at nogle hingste indeholder en større procentdel blod fra andre linier end deres egen. Et eksempel herpå er Sierra Kosmos, der tilhører Axworthy hingstelinien, men indeholder 9,3% McKinney, 7,2% Bingen, 13,1% Axworthy og 21,9% Peter the Great. For Florican er forholdet endnu mere misvisende. Han tilhører Axworthy hingstelinien, men indeholder 24,1% Peter the Great og kun 14,7% Axworthy.

Liniedannerne fra perioden 1940-1960 er:
  • Florican f.1947
  • Rodney f.1944
  • Star's Pride f.1947
  • Victory Song f.1943
Typisk indeholder vore dages travheste 16-20% Florican, 20-25% Rodney, 30-40% Star's Pride og 20-25% Victory Song.

Fra perioden 1960-1980 må følgende hingste karakteriseres som liniedannere:
  • Speedy Crown f.1968
  • Arnie Almahurst f.1970
  • Super Bowl f.1969
  • Nevele Pride f.1965
  • Noble Victory f.1962
Der er blevet linieavlet hårdt på Speedy Crown med eksempler som:
  • Royal Prestige (65,1% Speedy Crown og 39,3% Nevele Pride)
  • Armbro Goal (62,4% Speedy Crown)
  • Alf Palema (46,0% Speedy Crown og 45,5% Super Bowl)
  • Victory Dream (46,7% Speedy Crown og 28,3% Noble Victory)
  • Donerail (47,2% Speedy Crown og 37,4% Noble Victory)
  • Deliberate Speed (63,0% Speedy Crown og 38,1% Nevele Pride)
  • Muscles Yankee (46,6% Speedy Crown og 37,3% Noble Victory)
  • Legendary Lover K (57,9% Speedy Crown, 33,4% Arnie Almahurst og 29,4% Super Bowl)
  • Deweycheatumnhowe (47,1% Speedy Crown og 41,1% Noble Victory)
Nogle hingste har både Speedy Crown og Arnie Almahurst kraftigt repræsenteret i stamtavlen. Det er f.eks. Pine Chip, General November, Enjoy Lavec, Legendary Lover K, Scarlet Knight, Gigant Neo, Civil Action og Muscle Mass.

Super Bowl er ligesom Speedy Crown blevet benyttet intensivt til linieavl. Nogle eksempler er:
  • Express Ride (65,0% Super Bowl og 40,4% Arnie Almahurst)
  • Supergill (65,3% Super Bowl og 35,5% Nevele Pride)
  • Royal Troubador (67,6% Super Bowl og 40,3% Speedy Crown)
  • Super Arnie (64,5% Super Bowl og 41,6% Arnie Almahurst)
  • American Winner (65,0% Super Bowl og 30,0% Speedy Crown)
  • Malabar Man (43,5% Super Bowl og 33,4% Nevele Pride)
  • Viking Kronos (45,5% Super Bowl og 36,6% Nevele Pride)
  • Credit Winner (45,8% Super Bowl, 36,0% Speedy Crown og 30,9% Nevele Pride)
Ligesom ved kombinationen Speedy Crown/Arnie Almahurst er Super Bowl/Nevele Pride en kombination, der forstærker linieavlen indenfor samme hingstelinie. Eksempler på dette er Supergill, Giant Force, Striking Sahbra, Rite On Line, Malabar Man, Viking Kronos, Credit Winner, SJ's Caviar, From Above, Chocolatier og Crazed.

Speedy Crown og Super Bowl dominerer i stamtavlen hos de hingste, der hører til deres egne hingstelinier. Det gør Noble Victory ikke på samme måde. Ofte er der næsten samme slægtskabsgrad for 3-4 liniedannere. Det gælder f.eks. for Conway Hall, Broadway Hall, Windsongs Legacy, Majestic Son og Donato Hanover.

Liniedannerne fra perioden 1980-1990 er:
  • Valley Victory f.1986
  • American Winner f.1990
  • Garland Lobell f.1981
Chocolatier med 47,1% Valley Victory og 47,1% American Winner er et eksempel på en god kombination. Donato Hanover er et andet eksempel med 47,7% Garland Lobell og 36,1% Valley Victory.

Liniedannerne fra perioden 1990-2000 ser ud til at blive:
  • Yankee Glide f.1994
  • Muscles Yankee f.1995
  • Credit Winner f.1997
  • Conway Hall f.1995
Ken Warkentin (72,3% Yankee Glide) er indavl på Yankee Glide eller rettere på hans ophav.
Deweycheatumnhowe (75,9% Muscles Yankee) og Muscle Mass (76,6% Muscles Yankee) er indavl på Muscles Yankee og hans ophav.
Chocolatier (70,1% Credit Winner) og Crazed (70,7% Credit Winner) er indavl på Credit Winner og hans ophav.

Der er kommet nogle fremragende individer ud af ovennævnte indavl, men for racen som helhed må det frygtes, at tilsvarende indavl i stor stil vil få negative konsekvenser. Derfor er det tilrådeligt at anvende franske hingste i et vist omfang, hvilket man også gør i Skandinavien. USA og Canada derimod har hidtil ikke haft sucess med anvendelsen af fransk blod. Det skyldes naturligvis, at den amerikanske travsport er indrettet på sprinterløb for 2- og 3-årige heste, som heste med fransk blod ikke er specielt velegnede til.

9. december 2012

Pedigree Matching

  • Oprindelsen og grundlaget for Pedigree Matching teorien.
  • Primære og sekundære hingstelinier i stamtavlen som grundlag for opstilling af match.
  • Eksempler på matchtyper: Speedy Crown og Varenne.
Norman G Hall udgav i 1988 bogen "Pedigree Matching", der sammenfattede hans originale teorier og hans forskning i travavl. I 2005 publicerede han bogen "Queen among Queens", der beskriver udviklingen af hoppelinier fra nogle nøglehopper i travavlen.

Væddeløbsbladet, juni 2004, indeholdt en artikel om Pedigree Matching. På opfordring følger her et optryk af artiklen, idet jeg stadig får mange spørgsmål om teorien bag Pedigree Matching - en teori, der er meget omdiskuteret. Nogle mener, at det er rent vrøvl, og andre forestiller sig, at man med Pedigree Matching med stor sikkerhed kan finde den optimale kombination af hingst og hoppe. Begge dele er forkert efter min mening. Pedigree Matching teorien, linieavl, nøglehopper og X-faktor forbindelser er altsammen nyttige elementer ved valg af hingst/hoppe-kombination, men man må ikke glemme, at eksteriør, bevægelse og temperament er ligeså vigtigt som afstamning for resultatet af kombinationen.

Oprindelsen til teorien
Pedigree matching er et nyt navn på en gammel teori, idet den er baseret på Wallace’s American Trotting Register fra 1871 - det første forsøg på at dokumentere den amerikanske travers historie.
Den almindelige opfattelse dengang var, at man bedst producerede en god traver ved at krydse hopper, der viste gode evner for trav, med fuldblodshingste. Derved håbede man at forbedre både hurtighed og udholdenhed. John Wallace derimod mente, at det ville være fornuftigt “at forene to strømme, der stammer fra samme kilde, men som har været adskilt i nogle generationer”. Denne formulering er en lidt poetisk omskrivning for begrebet linieavl.

I fuldblodsavlen har succesrige avlere som Aga Khan og den legendariske Federico Tesio praktiseret balanceret linieavl, et koncept
med udgangspunkt i den statistiske kendsgerning, at indavl og linieavl på udvalgte individer gennem sønner og døtre har vist sig at give meget bedre resultater end gennem sønner alene eller døtre alene.

For at forstå pedigree matching må man først forstå begrebet hingstelinier, der fører nutidens travere tilbage til stamhingstene - ja helt tilbage til Wallace’s “kilde”, fuldblodshingsten Messenger (1780-1808), der havde særlige evner for trav.


Grundlaget for teorien
Den helt basale regel for “pedigree matching” er, at man skal føre det bedste blod fra hingstens mor tilbage til hingsten - en tese der stammer fra Federico Tesio. Det bedste blod er normalt defineret som hingstelinierne i den hoppe, man planlægger at avle på. Den simpleste udgave af tesen er således at finde en hoppe med hingstelinier på fadersiden (“primary match”) eller på modersiden (“maternal match”), der er de samme som på hingstens moderside.

Der er imidlertid også en anden form for match, der er vigtig i både traver- og fuldblodsavlen, nemlig “outmatch”. Denne form for match indfører bestemte hingstelinier, der “mangler” i stamtavlen. En “outmatch” kan sammenlignes med en “outcross”, men sidstnævnte er helt fri for linieavl, hvorimod “outmatch” er en speciel form for linieavl, hvor der som nævnt tilføjes en manglende eller svagt repræsenteret linie.

Hingstelinier
I Pedigree Matching anføres hingstelinierne for hver hest med seks bogstaver, hvor rækkefølgen af bogstaverne angiver positionen i stamtavlen af de pågældende hingstelinier. For alle travheste er der således anført fire primære hingstelinier og to sekundære hingstelinier. Bogstaverne angiver hvilken linie der er tale om:

S     Peter Scott linien
W   Worthy Boy linien
V    Victory Song linien
X    Axworthy linien

Primære og sekundære hingstelinier
Der er som nævnt flere typer af match, og den mest interessante er den primære match, hvor hingstelinierne fra farmor og morfar (de såkaldt primære hingstelinier) svarer til hinanden. Vi må derfor fokusere på den midterste del af stamtavlen for at bestemme en mulig match. Som det ses i det følgende, er der undertiden også brug for at anvende de sekundære hingstelinier, der kommer fra farfar og mormor, for at bestemme matchtypen.


Speedy Crown
Hvis vi eksempelvis sammenholder stamtavlen for Speedy Crown (kolonnen yderst til højre) med ovenstående tabel, så fremgår det, at han har følgende bogstavkoder (hvilket også er anført på stamtavlen foran navnet på far og mor):

Primære hingstelinier for far:         XSXV
Sekundære hingstelinier for far:      SX
Primære hingstelinier for mor:       XPXX
Sekundære hingstelinier for mor:    SW


Selv om bogstaverne ikke er i samme position, så optræder de med en enkelt undtagelse i samme antal for far og mor, idet der er tre linier til Axworthy (X), to til Peter Scott (S) og en til Victory
Song (V), henholdsvis Worthy Boy (W).
 
I en "full match" skal mindst tre af de fire primære hingstelinier være fælles, og matchen er særlig stærk, hvis de samme hingstelinier også optræder som sekundære hingstelinier på modersiden.
 
For Speedy Crown ser vi, at hingstelinierne i Scotch Love fører tilbage til Peter the Great (2 steder) og Axworthy (2 steder), sidstnævnte via hans sønner Guy Axworthy og Dillon Axworthy. Fra Florican ser vi Guy Axworthy (2 steder), Lee Axworthy (søn af Guy Axworthy) og Peter the Great. Fra Worth A Plenty ses Guy Axworthy igen samt Peter the Great 5 steder ud af 8 mulige, heraf 2 steder via sønnen Peter Volo og et enkelt sted via hver af sønnerne Chestnut Peter og Peter the Brewer.

Stamtavlen for Speedy Crown viser således den ultimative "full match", idet alle elementerne i hans mor genfindes i hans farmor, Scotch Love.

Varenne
Stamtavlen for Varenne viser følgende koder:

Primære hingstelinier for far:          WSSW
Sekundære hingstelinier for far:       SW
Primære hingstelinier for mor:        VXWS
Sekundære hingstelinier for mor:     SW

Der er således tale om en "full match", hvis man lader X indgå i stedet for S. Det lyder måske forvirrende, men begrundelsen er, at det første S i koden er Blaze Hanover (S), hvis mor er ved Mr McElwyn (X). Dette er en typisk anvendelse af X som erstatning for en anden kode.

Stamtavlen for Varenne er også et godt eksempel på de X-faktor forbindelser, som formentlig har haft stor betydning for, at hesten er blevet en så fantastisk god væddeløber. Ialmaz kombinerer fire stærke Miss Russel forbindelser, og hun er ligesom sin mor og mormor en X-faktor dobbeltkopi via Miss Russel. Hendes far, Zebu, har en X-faktor forbindelse til Margaret Parrish via Protector. Hendes mor er ved Speedy Crown, som har forbindelse til Miss Russel via Fionne. Hendes mormor er ved Stars Pride, der har forbindelse til Miss Russel via Dillcisco, og hendes oldemor har Miss Russel på mødrene side via Scotch Rhythm ved Volomite. Scotch Rhythm har også en stærk X-faktor forbindelse i moderlinien via Mambrino Patchen, og da hun blev kombineret med Dean Hanover, hvis oldemor er stærkt indavlet på Mambrino Patchen, blev resultatet Silken Hanover, tipoldemor til
Ialmaz. Dean Hanover findes også på modersiden af Zebu, og den forstærker således X-faktor forbindelserne i Ialmaz.
 
Ialmaz har følgende koder, og hun er ligesom sønnen, Varenne, en "full match". Men hun er også en perfekt “maternal match”, idet alle fire hingstelinier i hendes mormor, Spree Hanover, svarer til hingstelinierne i hendes farmor, Keystone Lady:

Primære hingstelinier for far:          XSXW
Sekundære hingstelinier for far:       VX
Primære hingstelinier for mor:        SVXS
Sekundære hingstelinier for mor:     WS

Foruden at undersøge hvilken type match, der er tale om, samt eventuelle X-faktor forbindelser, bør man se på, om kombinationen giver linieavl eller ligefrem indavl. Igen er stamtavlen for Varenne interessant at studere, idet det fremgår, at Varenne er dobbelt linieavlet 3 x 3 på Speedy Crown. Det anførte 3 x 3 betyder, at Speedy Crown findes to steder i stamtavlen 3 generationer tilbage. Varenne er også linieavlet 6 x 6 på Volomite. Faktisk er hans farfar, Speedy Somolli, og hans mormor,
Baree, meget tæt på at have samme stamtavle d.v.s. at være helsøskende i blodet:
  • Speedy Somolli ved Speedy Crown af Somolli ved Stars Pride af Laurita Hanover ved Hoot Mon af Lark Hanover ved Dean Hanover.
  • Baree ved Speedy Crown af Spree Hanover ved Stars Pride af Spry Hanover ved Hoot Mon af Silken Hanover ved Dean Hanover.
Varenne er eksempel på, at teorierne om "full match", X-faktor forbindelser og linieavl måske kan bidrage til at forbedre avlen. Der er mange andre topheste, der ligesom Varenne opfylder kriterierne i henhold til teorierne. Men der er selvfølgelig også gode heste, der ikke svarer til teorierne, ligesom der er dårlige heste, der teoretisk burde være gode. Hvorvidt man vil bruge Pedigree Matching, X-faktor forbindelser, nøglehopper, linieavl eller en kombination af alle disse teorier til at understøtte sine egne beslutninger er et helt personligt valg. Teorierne er et værktøj, som aldrig kan erstatte erfaring og viden om heste og hesteavl.

29. oktober 2012

Trot-Pedigree, Pedigree Matching GlobeTrotter, PedigreeGuru og Blodbanken

Trot-Pedigree, Pedigree Matching GlobeTrotter, PedigreeGuru og Blodbanken er uundværlige databaser for enhver, der er seriøst interesseret i travavl. I det følgende er der en kort beskrivelse af disse applikationer med tilhørende links.
 
Franske travhingste er meget brugt i avlen både i Danmark og Sverige, og heldigvis er der gode informationer at hente om stamtavler, avls- og løbskarrierer for franske travheste i en database som gratis kan downloades på Trot-Pedigree, og som derfor kan bruges offline. Trot-Pedigree er nok den mindst kendte af de nævnte databaser, men den er intet mindre end fremragende. Til illustration af Trot-Pedigree og de andre databaser er vist stamtavlen for Ready Cash, men der kan hentes mange andre typer af informationer. Man skal ikke lade sig afskrække af, at den er fransk. Programmet er let at bruge, selv om man ikke er særlig franskkyndig.

Stamtavle for Ready Cash i Trot-Pedigree
 
En anden database, der kan downloades og dermed bruges offline er Pedigree Matching GlobeTrotter. I modsætning til Trot-Pedigree indeholder GlobeTrotter heste fra hele verden med hovedvægten på USA og Canada. Globetrotter koster 195 Canadiske dollars eller ca. 1.100 kr.
GlobeTrotter er udarbejdet af Norman Hall og sønnen Chuck (Charles) Hall som efterfølger for Pedigree Matching 99, der vil være bekendt for en del danske avlsinteresserede, der deltog i et seminar arrangeret af Opdrætterforeningen med Norman Hall på Fyn eller et senere seminar arrangeret af undertegnede med Norman Hall i Fredericia.

GlobeTrotter indeholder mere end én million heste, og det er verdens største internationale database over travheste og pacere (Standardbred). GlobeTrotter kan foruden stamtavler generere en lang række forskellige rapporter over afkom, efterkommere, hoppelinie, hingstelinie, salgskatalogside, hypotetisk stamtavle og avanceret søgning.

Stamtavle for Ready Cash i Globetrotter
 
Online-udgaven af Pedigree Matching Globetrotter er PedigreeGuru, der indeholder den samme database som Globetrotter. PedigreeGuru kan generere de samme rapporter som GlobeTrotter. PedigreeGuru er dermed den største online travheste-database i verden. PedigreeGuru koster 200 Canadiske dollars eller ca. 1.150 kr for ét år.
 
Om kort tid åbner Norman Hall en ny Pedigree Matching-side, der får navnet PM-Online og som kommer til at indeholde Globetrotter for travheste og Globerunner for fuldblodsheste. PedigreeGuru abonnementer vil automatisk blive overført til PM-Online.
 
Stamtavle for Ready Cash i PedigreeGuru
 
Den svenske online-database Blodbanken er gratis i en basisudgave, men pro-udgaven, som indeholder alle de værdifulde hingstestatistikker m.m. koster 600 svenske kroner for ét år. Blodbanken pro er alle pengene værd. Hingstestatistikkerne årgang for årgang findes ikke andre steder, og de er uundværlige til vurdering af hingstenes kvalitet.
 
Blodbanken er en guldgrube for alle, der er interesserede i travavl. Der er stamtavler, hypotetiske (test)stamtavler, afkomslister for faderhingst, moderhoppe og morfarhingst, hingstestatistikker årgang for årgang, virtuel avlsvejleder, avanceret søgning, avanceret test-stamtavle, liniedannende hingste, storløb, elitehopper, artikler og forum samt hestebørs.

Stamtavle for Ready Cash i Blodbanken
 

29. januar 2010

Speed/Stamina Gene identified

Since the horse genome sequence became available in 2007, many of the genes contributing to the elite athletic physiology and physique of the horse have been identified: these include genes responsible for insulin signalling, metabolism of fats and muscle strength.

The genome is the complete complement of genetic material within an individual and carries the instructions for building and maintaining a living organism. The genetic material, known as DNA, is made up of the letters G, A, T and C. Various combinations of these letters make up the 3 billion letters of the genetic code. Approximately 25,000 genes are found within the genome, each gene spelling out the recipe for a particular protein. Proteins are the building blocks of cells and are the physical representation of the genetic information encoded in the DNA of the genome.

Research conducted at University College Dublin has developed technology that can be used to predict best race distance for an individual horse.

In a gene responsible for muscle mass development, a specific position in the genetic code can contain either the letter C or the letter T. As each individual has two copies of the gene—one inherited from the dam, one from the sire—there are three possible combinations of the letters: C:C, C:T or T:T.

The success of a racehorse depends on a combination of inherited characteristics (genes) and environmental influences including management and training. Pedigree studies have demonstrated that more than 35 percent of the variation in racecourse performance is due to inherited characteristics. In a situation where individuals are cared for and trained in the same way, the genetic contribution to racing performance will be considerably more important. In other words, all other things being equal, the main differences between two individuals in a yard will be in the genes.

The work, led by Dr Emmeline Hill at University College Dublin, was published January 20, 2010 in the Public Library of Science Journal, PLoS ONE.

For more details see:
Hill EW, Gu J, Eivers SS, Fonseca RG, McGivney BA, et al. (2010) A Sequence Polymorphism in MSTN Predicts Sprinting Ability and Racing Stamina in Thoroughbred Horses.
PLoS ONE 5(1): e8645. doi:10.1371/journal.pone.0008645

1. januar 2007

X-faktor teorien

Genetiske regler for X-faktoren
En hest har 64 kromosomer i hver eneste celle (31 autosompar og 1 par kønskromosomer). Kønskromosomerne kaldes X- og Y-kromosomer. Et sted på kromosomerne, der styrer en bestemt egenskab, kaldes et locus. Et locus indeholder et gen fra faderen og et gen fra moderen.

I 1995 startede et internationalt forskningsprojekt med det formål at kortlægge hestens gener, og i 2007 nåede man målet. Hestens genom (arvemasse) med 30.763.255 DNA-sekvenser var da samlet i en database, og rækkefølgen af sekvenserne var fastlagt og ordnet langs de 32 kromosompar. Der er dog endnu ikke identificeret noget gen for ”stort hjerte”.

Gener kan være dominante, recessive, codominante eller intermediære. Dominante gener slår igennem i enkelt dosis. Mindst en af forældrene vil også have genet. Dominante gener skrives med stort. Recessive gener skal være tilstede i dobbelt dosis for at slå igennem. Recessive gener skrives med småt. Codominante gener betegner dominante gener, der er lige stærke, og hvor begge gener kan komme til udtryk. Intermediære gener er også dominante gener, der er lige stærke, men hvor resultatet bliver en mellemting.

Ifølge Dr. Anthony Stewart fra University of Sydney skyldes egenskaben ”stort hjerte” et codominant gen på X-kromosomet. X-kromosomet kan således enten indeholde et gen for ”stort hjerte”, hvilket indikeres med X , eller et gen for ”normalt hjerte”, hvilket indikeres med X. Hingste har et X-kromosom og et Y-kromosom, og de kan derfor beskrives som enten XY eller XY. Alle af kategorien XY har et stort hjerte, medens ingen af kategorien XY har et stort hjerte. Hopper har to X-kromosomer, og de kan beskrives som enten XX, XX eller XX. Alle med betegnelsen XX har et stort hjerte, medens det er 50/50 for XX, og ingen med betegnelsen XX har et stort hjerte.

Når man kombinerer en hingst og en hoppe, bliver der følgende 6 kombinationer, idet et gen kommer fra hingsten og et gen fra hoppen (Prøv selv at tage et bogstav fra hingstens betegnelse og et bogstav fra hoppens betegnelse og se, at der er de muligheder, som er anført efter pilen):
1. Hoppe med dobbelt X-faktor og hingst med X-faktor
XX / XY → XX, XY
2. Hoppe med enkelt X-faktor og hingst med X-faktor
XX / XY → XX, XX, XY, XY
3. Hoppe uden X-faktor og hingst med X-faktor
XX / XY → XX, XY
4. Hoppe med dobbelt X-faktor og hingst uden X-faktor
XX / XY → XX, XY
5. Hoppe med enkelt X-faktor og hingst uden X-faktor
XX / XY → XX, XX, XY, XY
6. Hoppe uden X-faktor og hingst uden X-faktor
XX / XY → XX, XY

Resultatet af kombinationerne1. XX / XY → XX, XY
Stjernekombinationen med en dobbelt X-faktor hoppe og en X-faktor hingst er desværre uhyre sjælden. Alle afkom får et stort hjerte.

2. XX / XY → XX, XX, XY, XY
Kombinationen med en X-faktor hoppe (50 % af disse har et stort hjerte) og en X-faktor hingst (alle disse har et stort hjerte) er også sjælden. Her vil 50 % af hingstføllene og 75 % af hoppeføllene få et stort hjerte. Af hoppeføllene vil 50 % få dobbelt X-faktor og 50 % enkelt X-faktor. Alle med dobbelt X-faktor vil få et stort hjerte, og 50 % af dem med enkelt X-faktor vil få et stort hjerte.

3. XX / XY → XX, XY
Kombinationen med en hoppe uden X-faktor og en hingst med X-faktor er mere almindelig, om end uhensigtsmæssig på kort sigt, idet ingen hingstføl vil få stort hjerte. Alle hoppeføl vil få en enkelt X-faktor, og 50 % af disse vil få et stort hjerte. I avlen vil de 50 %, der ikke får et stort hjerte dog være lige så værdifulde, idet de bærer X-faktor genet som et recessivt (vigende) arveanlæg. Med andre ord vil de i lige så høj grad kunne viderebringe X-faktoren til deres afkom.

4. XX / XY → XX, XY
Kombinationen med en dobbelt X-faktor hoppe og en hingst uden X-faktor har haft stor succes i amerikansk fuldblodsavl, hvor mange eliteheste er produceret efter den recept. Antallet af dobbelt X-faktor hopper er dog særdeles begrænset, så kombinationen er trods alt sjælden. Man bruger en speedhingst til en distancestærk (men for langsom) hoppe og håber så, at føllet får speed fra hingsten og distance fra hoppen. Hvis hoppen har dobbelt X-faktor, så vil alle hingstføl og 50 % af alle hoppeføl få et stort hjerte. Alle hoppeføl vil få en enkelt X-faktor, og også de 50 %, der ikke får et stort hjerte, vil være værdifulde i avlen, idet de bærer X-faktor genet som et recessivt (vigende) arveanlæg.

5. XX / XY → XX, XX, XY, XY
Kombinationen med en X-faktor hoppe og en hingst uden X-faktor ligner ovennævnte, idet man bruger en speedhingst til en distancestærk hoppe og håber, at føllet får speed fra hingsten og distance fra hoppen. Hvis hoppen har en enkelt X-faktor vil 50 % af hingstføllene og 25 % af hoppeføllene få et stort hjerte. Halvdelen af hoppeføllene vil få en enkelt X-faktor, og halvdelen vil være uden X-faktor. Så hurtigt kan man faktisk avle X-faktoren bort, hvis man er uheldig.

6. XX / XY → XX, XY
Kombinationen, hvor hverken hoppe eller hingst har X-faktor, er desværre den mest almindelige, og ingen afkom vil få X-faktor.

Forskningsprojekter om store hjerterHjertets størrelse kan måles på en levende hest ved elektrokardiografi (EKG) eller ved ekkokardiografi (ultralyd). Når disse målinger sammenholdes med hestenes præstationer, kan betydningen af hjertets størrelse vurderes. I flere undersøgelser har der vist sig en signifikant korrelation mellem gode præstationer og stort hjerte. Ud fra en dansk undersøgelse i 1980 kan det konkluderes, at 22 % af præstationsevnen skyldes hjertets størrelse, og de resterende 78 % skyldes alle andre faktorer tilsammen. Flere af projekterne har omfattet hoppefamilier, og de har samstemmende vist, at store hjerter synes at være forbundet med X-kromosomet.

ElektrokardiografiI 1953 begyndte Dr. James Steel, professor i veterinær medicin på University of Sydney, Australien, at måle størrelsen af hjertet på væddeløbsheste ved hjælp af elektrokardiografi (EKG), og den første rapport (baseret på undersøgelse af 306 fuldblodsheste) blev udsendt i 1957. Hovedrapporten (baseret på undersøgelse af 2.500 fuldblodsheste) udkom i 1963. En af James Steels medarbejdere, Dr. Anthony Stewart, har fortsat arbejdet, og også andre forskergrupper har bidraget til at kaste lys over emnet. I Danmark udgav K. Nielsen og G. Vibe-Petersen fra KVL i 1980 en rapport over deres undersøgelser af 230 travheste, og i USA har forfatteren Marianna Haun, Dr. Fred Fregin og Dr. Gus Cothran, University of Kentucky, siden 1993 målt mere end 1.000 heste ved hjælp af EKG samt forsket i den genetiske sporbarhed af de store hjerter.

James Steel opfandt begrebet ”Heart Score” som udtryk for hjertets størrelse. Hestens ”Heart Score” måles på elektrokardiogrammet (EKG) som bredden af QRS kurven målt i mSek. Enheden på Y-aksen er mV.

Ekkokardiografi
Det var radiologen Norman Rantanen, der sammen med Dr. Anthony DeMaria udviklede anvendelsen af todimensional ekkokardiografi (ultralyd) til måling af hjerter på heste. Rantanen begyndte sine målinger i 1983 i Kentucky, og han har foretaget målinger på næsten 4.000 heste. Han har også foretaget sammenlignende undersøgelser af de to metoder, EKG og ultralyd, idet de samme heste blev undersøgt med begge metoder - ultralyd ved Rantanen og EKG ved Dr. Doug Byars.

Dyrlægen David Lambert lærte metoden af Rantanen, og da denne ikke kunne skaffe midler til at fortsætte projektet, videreførte Lambert de praktiske og statistiske undersøgelser på privat basis. Derfor er Lambert nu efter Rantanens mening den, der ved mest om metoden. Han offentliggør imidlertid intet videnskabeligt materiale, fordi det er en bedre forretning at sælge rådgivning direkte til de store hesteejere og stutterier. I USA er det nemlig blevet en lukrativ forretning for enkelte specialister at foretage ekkokardiografi af 1-åringer på de store auktioner. Det forhindrer ikke, at andre kan bruge metoden, men det er ærgerligt, at manden med den største ekspertise inden for området ikke ønsker at dele sin viden med andre.
I Danmark har Rikke Buhl anvendt ekkokardiografi ved hjerteskanning af 132 travheste født i 1999 (G-årgangen). Resultaterne indgår i hendes Ph.D. afhandling, ”Development of cardiac dimensions assessed by echocardiography in young standardbred trotters”, som hun forsvarede på KVL den 8. oktober 2004.

Ekkokardiografi af hestehjerte